Gebzespor, 6 yıl aranın ardından yeniden profesyonel liglere döndü. En son 2018-2019 sezonunda TFF 3. Lig’de mücadele eden Gebzespor, o sezon sonunda Bölgesel Amatör Lig’e düşmüştü. 2024-2025 sezonunun devre arasında Belediye Derincespor’un yarışma haklarını devralan Gebzespor, bu gelişmeyle birlikte 2025-2026 sezonunda TFF 2. Lig’de mücadele etmeye hak kazandı. Belediye Derincespor’un ligin son haftasında deplasmanda Nazilli Belediyespor’u 5-1 mağlup etmesiyle birlikte ligde kalması kesinleşti ve Gebzespor da böylece profesyonel ligde yer alma hakkını korumuş oldu. Gebzespor, son olarak 2010-2011 sezonunda TFF 2. Lig’de mücadele etmişti. Böylece kulüp, 15 yıl aranın ardından tekrar 2. Lig’e dönmüş olacak.